А бывают ли такие хозяева жилья в Магнитогорске которые принципиально не сдают квартиры через агентства?

Конечно да. Это могут быть люди пожилого возраста, доверяющие только себе и сдающие комнаты студентам. 

Либо арендодатели, жадные до чужих денег. Они сдают свои квадратные метры лично по завышенным ценам, причём с залогом, который они не вернут никогда! Ведь при самом бережном отношении к вещам, естественный износ будет в любом случае и всегда у таких хозяев будет повод к чему-нибудь придраться. Некоторые из них даже претендуют на комиссионные (мол, вы и так бы заплатили эти деньги риелтору)! 

Бывают среди владельцев жилья пожилые женщины (как правило) напуганные налогами. Они ни за что не подпишут с Вами договор найма и будут Вас просить рассказывать соседям, что Вы их дальние родственники. Хотя залога не потребуют и цены не будут резко повышать. Эта категория владельцев жилья ищет квартирантов преимущественно через знакомых.

Если вы уже созвонились с хозяином объявления, в котором предлагается квартира внаём и вы уже договорились о встрече и осмотре помещения - подумайте о собственной безопасности (уточните, вправе ли этот незнакомый Вам человек её сдавать?). Аренда квартир без посредников – серьёзное решение, ответственность за которое лежит только на вас.